воскресенье, 19 июля 2015 г.

Каталогизатор JabRef

Во время написания всяческих научных работ, всегда требуется работа с литературой. Вам необходимо ознакомиться и кратко изложить то, что ранее делали люди. Все эти объемы источников необходимо определенным образом структурировать, что бы в дальнейшем эффеткивно их использовать. Для этой цели используют разный софт. И об одной из программ я здесь очень кратко расскажу.
С чего начать?
Скачиваем и устанавливаем программу JabRef . Эта программа работает на Java, по этому данный компонент должен у вас быть.

Далее примеры буду приводить на оформлении ссылки на статьи с иностранных журналов, т.к.  приходится работать именно с этими статьями и делаю все с живого опыта.

Как добавить данные в базу.
Создаем новый документ и жмем на зеленый плюс:

Выбираем тип источника:

Заполняем, появившуюся перед вами форму:

Важно! Между авторами не должно быть запятой или других знаков. Между ними ставится "and".   Если поставить запятую между авторами, то программа воспримет ее как разделение не двух авторов, а перечисление имен одного автора. Это в дальнейшем приведет к неправильному сокращению имени.

Заполнять форму можно руками, перенося все данные из статьи или сайта журнала в соответсвующие поля формы. 
А так же это можно несколько упростить, воспользовавшись BibTex ссылками на литературу из Scopus (для счастливчиков) или же из Google Scholar: 

Заходим в Google Scholar и ищем необходимую нам статью и жмем цитировать:

Дальше нажимаем на BibTeX:

Копируем BibTex:



Вставляем скопированный текст в "BibTex Source" :



Обратите внимание! BibTex с Google Scholar я скопировал не полностью (без первой и последней строки), а вставлял в программу начиная со второй строки. Это было сделано для того что бы сохранить временной штамп и имя того кто этот источник добавил.

Важно! Внимательно следите, что бы не забыли поставить запятую в конце строки "publisher" перед строкой "Owner". В противном случае программа будет ругаться и данные не добавятся.

Можно копировать BibTex с Google Scholar  полностью и вставлять его полностью заменяя имеющийся BibTex. Ничего страшного не будет. Просто потом вы не увидите данных в полях "Owner" и "Timestamp" (но их можно добавить руками).

BibTex Key важный элемент при создании Вашего каталога литературы. Зачем и как можно пользоваться ключем я расскажу в следующей статье, где опишу как в атоматическом режиме оформить список литературы. Скажу лишь одно, используйте оригинальный ключ хотя бы в пределах одного .bib файла.

Ну и в принципе все. Создавайте свои базы литературы с пользой. Работа с программой, как можно заметить выше, не сложная и интуитивно понятная. Сначала может показаться, что это отнимает очень много времени (внесение информации о источниках), но поверьте мне, это Вам очень поможет в будущем когда будете писать литературный обзор с не одним десятком, а то и сотней ссылок. И вдруг потом вам потребуется добавить одну или несколько ссылок в средину или начало обзора, тогда Вам придется менять нумерацию во всем документе, а также в списке литературы. Когда будете писать статью, помимо вышеописанной проблемы, можете с толкнуться с тем, что одна редакция завернет статью и придется ее посылать в другую, где порядок стиль оформления списка литературы иной и будете переоформлять несколько десятков источников по новым требованиям. 

Как в автоматическом режиме оформлять список литературы опишу позже.
Очень помог онлайн учебник из которого я и питаю информацию.
Возможно эту статью буду дополнять и расширять в дальнейшем.

вторник, 17 июня 2014 г.

Ящик Пандоры

Проводя ревизию в многочисленных ящиках своей убогой лаборатории наткнулся на одну не очень обычную вещицу. Изучив ее содержимое, про себя я ее назвал "Ящик Пандоры. Ниже приведу несколько фото.

Вот такой увесистый металлический контейнер. Лежал достаточно давно не тронутым и был покрытый пылью.




От  увиденного, я мягко говоря, заволновался.



    Ниже приведу перечень того, что там было:

  1. Дифосген- трихлорметиловый эфир хлормуравьиной кислоты.
  2. Подвижная жидкость, без цвета, с характерным запахом прелого сена, на воздухе дымит. Хорошо растворим в органических растворителях (бензол, толуол, четыреххлористый углерод, ацетон), плохо растворим в воде.
    Высокотоксичен, вызывает удушающее и раздражающее действие.

    Яд удушающего действия для человека и других животных с замедленным по времени наступлением смерти. Симптомы отравления фосгеном или дифосгеном: мучительный кашель, выделение мокроты с примесью крови, посинение кожи (цианоз), отёк лёгких. Отравление может протекать незаметно для больного, а первые симптомы отравления появляются только спустя несколько часов (5-12 часов с момента начала вдыхания малых концентраций фосгена или дифосгена). Заметить фосген или дифосген в воздухе можно по характерному "тухлому" запаху, похожему на запах прелого сена. Табачный дым в атмосфере даже с малой примесью фосгена или дифосгена меняет свой запах и для курящего становится неприятным, что может служить элементарным методом определения фосгена и дифосгена в воздухе. Отравления фосгеном или же дифосгеном могут случиться не только на полях боевых сражений, но и при авариях на предприятиях по производству различных пластмасс.

  3. Сини́льная (циа́нистоводородная) кислота́, цианистый водород, HCN[1] — бесцветная, очень летучая, легкоподвижная ядовитая жидкость, имеющая характерный запах[2].
  4. Синильная кислота содержится в некоторых растениях, коксовом газе, табачном дыме, выделяется при термическом разложении нейлона, полиуретанов. Смешивается во всех соотношениях с водой, этанолом, диэтиловым эфиром.
    Синильная кислота — сильный яд общетоксического действия, блокирует клеточную цитохромоксидазу, в результате чего возникает выраженная тканевая гипоксия.Средние летальные дозы (LD50) и концентрации для синильной кислоты[5]:
  5. Мыши:
  6. орально (ORL-MUS LD50) — 3,7 мг/кг
  7. при вдыхании (IHL-MUS LD50) — 323 м.д.
  8. внутривенно (IVN-MUS LD50) — 1 мг/кг
  9. Кролики
  10. внутривенно (IVN-RBT LD50) < 1 мг/кг
  11. Человек, минимальная опубликованная смертельная доза (ORL-MAN LDLo) < 1 мг/кг
  12. Впервые в роли боевого отравляющего вещества синильная кислота была использована французской армией 1 июля 1916 года на реке Сомме[3]. Однако из-за отсутствия кумулятивных свойств и малой стойкости на местности последующее использование синильной кислоты в этом качестве прекратилось.
    Синильная кислота являлась основной составной частью препарата «Циклон Б», который был наиболее популярным в Европе во время Второй мировой войныинсектицидом, а также использовался нацистами для убийства людей в концентрационных лагерях. В некоторых штатах США синильная кислота использовалась в газовых камерах в качестве отравляющего вещества при исполнении приговоров смертной казни, в последний раз это было сделано в Аризоне в 1999 году.[4] Смерть, как правило, наступает в течение 5—15 минут.

  13. Хлорпикри́н (трихлорнитрометан) CCl3NO2 — жидкость с резким раздражающим запахом; технический продукт может иметь различные оттенки запаха в зависимости от чистоты и способа получения. Используется как компонент фумигантных смесей в сельском хозяйстве[1].
  14. Пары хлорпикрина обладают сильным слезоточивым, а в высоких концентрациях — удушающим и общеядовитым действием. В этой связи хлорпикрин ограниченно применялся в Первой мировой войне как боевое отравляющее вещество (например, против русской армии летом 1915 года), а также в качестве растворителя для боевого применения других БОВ (впервые — в середине 1916 года немецкой армией в смеси с дифосгеном).
    Из-за невысокой для современных ОВ токсичности и сильного раздражающего действия хлорпикрин не рассматривается как боевое ОВ. С другими ОВ хлорпикрин также в настоящее время не используется, поскольку его раздражающее действие практически сразу дало бы возможность обнаружить применение ОВ.
    Благодаря раздражающему действию и простоте обращения хлорпикрин используется в качестве учебного (имитация газовой атаки) и проверочного тестирование средств химзащиты ОВ. Для этого в армейской палатке умеренное количество хлопикрина, порядка 50 мл, подогревается на водяной бане. Однако из-за того, что при нагревании хлорпикрин разлагается с образованием фосгена, применение его в качестве учебного ОВ требует соблюдения мер предосторожности. В связи с этим в настоящее время хлорпикрин как учебное ОВ постепенно заменяется другими ОВ раздражающего действия.
     В качестве смертельной концентрации указывают 2 мг/л при экспозиции 10 мин. При такой концентрации смерть наступает в течение нескольких минут.

  15. Табун (нем. Tabun) — этиловый эфир диметиламида цианофосфорной кислоты — фосфорорганическое соединение, бесцветная подвижная жидкость с t. кип. 220 °C, t пл −50 °C, плохо растворим в воде (около 12 %), хорошо в органических растворителях.
  16. Табун — нервно-паралитическое отравляющее вещество (ОВ), ингибитор холинэстеразы. Смертельная концентрация табуна в воздухе 0,4 мг/л (1 мин), при попадании на кожу в жидком виде — 50-70 мг/кг; в концентрации 0,01 мг/л (2 мин) табун вызывает сильный миоз (сужение зрачка). Защитой от табуна служит противогаз в сочетании с защитным комбинезоном, антидоты, например, атропин.
    Табун впервые был получен перед Второй мировой войной, применялся в газовой атаке в Халабдже.
    Но в ампуле почему-то он красного цвета.

  17. Хлорацетофено́н (CN) C6H5COCH2Cl — боевое отравляющее вещество из группы лакриматоров — слезоточивых веществ (ОВ раздражающего действия). Применялся в качестве полицейского средства для разгона демонстрантов, захвата преступников и пр. В настоящее время из-за высокой токсичности постепенно вытесняется более безопасными ирритантами —CS, CR, OC, PAVA.
  18. лорацетофенон — типичный лакриматор, раздражение дыхательных путей выражено гораздо слабее чем при поражении CS и ОС. Начало действия через 0,5—2 мин. Продолжительность раздражающего действия 5—30 мин. Симптомы постепенно исчезают через 1—2 часа. Нахождение в облаке CN более 5 мин. считается опасным.
  19. Глаза: Слезотечение и резкая боль. При попадании растворов в глаза может вызывать ожог и помутнение роговицы, ослабление зрения.
  20. Дыхательные пути: пощипывание в носу, легкое жжение в горле, при высоких концентрациях — выделения из носа, боли в горле, возможны затрудненное дыхание, кашель.
  21. Кожа: Раздражающее действие, напоминающее ожог с образованием волдырей. Сильнее действует на влажную кожу. Вопреки распространённому мнению, хлорацетофенон гораздо более сильный кожный ирритант, чем CS. Накожная аппликация всего 0,5 мг CN в течение 60 мин. вызывает эритему у всех испытуемых. (для CS — не менее 20 мг).
  22. Адамси́т (дигидрофенарсазинхлорид) — HN(C6H4)2AsCl. Относится к группе веществ, раздражающих верхние дыхательные пути (стернитов); применяется в качестве ядовитого дымообразователя.
  23. Поражение через органы дыхания:
  24. LCt50, (г·мин)/м³ — 85,00
  25. jCt50, (г·мин)/м³ — 0,030
  26. Поражение через кожу:
  27. LD50, мг/человек — 1000
  28. Примечание:
  29. LCt50 — средняя токсодоза, вызывающая смертельный исход у 50 % поражённых
  30. jCt50 — средняя выводящая из строя токсодоза, обеспечивающая выход из строя в 50 % случаях
  31. PCt50 — средняя пороговая токсодоза, вызывающая начальные симптомы поражения у 50 % поражённых
  32. LD50 — средняя смертельная токсодоза (для проникающих через кожу Боевых Отравляющих Веществ)
  33. Ипри́т (или горчичный газ, синонимы: 2,2'-дихлордиэтиловый тиоэфир, 2,2'-дихлордиэтилсульфид, 1-хлор-2-(2'-хлорэтилтио)-этан, «Лост») — химическое соединение с формулой S(CH2CH2Cl)2. Является боевым отравляющим веществом (ОВ) кожно-нарывного действия, по механизму действия — ОВ цитотоксического действия, алкилирующий агент.
  34. Был синтезирован Сезаром Депре в 1822 году и (независимо) британским учёным Фредериком Гутри (Frederick Guthrie) в 1860 году[1].
    Впервые иприт был применён Германией 12 июля 1917 года против англо-французских войск, которые были обстреляны минами, содержавшими маслянистую жидкость, у бельгийского города Ипра (откуда и произошло название этого вещества).
    Во время Второй мировой войны иприт применялся только один раз Польшей, при этом погибли два немецких солдата, а двенадцать получили поражения разной степени тяжести[источник не указан 1751 день]. Кроме того, иприт применялся в итало-эфиопскую войну 19351936 годов.
    Во время Великой Отечественной войны в г. Дзержинск на заводе 96 (ныне «Сибур-нефтехим») производили иприт. Работники этого завода, получившие легочные поражения парами иприта, в послевоенное время вплоть до 1990-х годов ежегодно проходили лечение в спецсанатории «Карасан» в 15 километрах к юго-западу от Алушты (между Алуштой и Ялтой)
    По иприту лучше почитать Википедию, там написано много интересного.

  35. Люизит — смесь изомеров β-хлорвинилдихлорарсина (α-люизита), бис-(β-хлорвинил)хлорарсина (β-люизита) и трихлорида мышьяка. Тёмно-коричневая жидкость с резким раздражающим запахом, напоминающим запах герани, отравляющее вещество кожно-нарывного действия, названа по имени американского химика Уинфорда Ли Льюиса (Winford Lee Lewis 1879–1943).
  36. Пребывание в течение 15 минут в атмосфере, содержащей люизит в концентрации 0,01 мг на литр воздуха, приводит к покраснению слизистых глаз и отёку век. При более высоких концентрациях ощущается жжение в глазах, слезоточение, спазмы век. Пары люизита действуют на кожные покровы. При концентрации 1,2 мг/л уже через одну минуту наблюдается покраснение кожи, отёк; при более высоких концентрациях на коже появляются пузыри. Действие жидкого люизита на кожу проявляется ещё быстрее. При плотности заражения кожных покровов в 0,05-0,1 мг/см² происходит их покраснение; при концентрации 0,2 мг/см² образуются пузыри. Смертельная доза для человека составляет 20 мг на 1 кг веса, т.е. люизит при кожной резорбции примерно в 2-2,5 раза токсичнее иприта. Однако это его преимущество несколько нивелируется отсутствием периода скрытого действия, что даёт возможность своевременно принять противоядие и/или обработать поражённые участки кожи с помощью индивидуального противохимического пакета. При попадании люизита в желудочно-кишечный тракт возникает обильное слюнотечение и рвота, сопровождающаяся острыми болями, падением кровяного давления, поражением внутренних органов. Смертельная доза люизита при попадании его внутрь организма составляет 5-10 мг на 1 кг веса.

  37. Трихлортриэтиламин  Т.О.(азотистый иприт) - в своем действии похож на иприт, но обладает рядом особенных свойств.
  38.   

Ну а во второй части это го "Ящика Пандоры" осталась, как полагается мифу, лишь надежда, т.е. антидоты.

понедельник, 15 апреля 2013 г.

День химфака

13 апреля прошел очередной день химического факультета нашего университета. Традицию отмечать день рождения факультета переняли у белорусских химиков в 70-х годах прошлого столетия. Но этот ДХ был для меня не совсем обычным. По традиции выпускной курс в конце мероприятия(концерт) исполняет танец лебедей. Вот и мне пришлось исполнять сей ритуал=)
Позже выложу и видео самого танца...


Преподаватели и 5-й курс


Главные танцоры=)

четверг, 21 февраля 2013 г.

Заключительный этап

Сегодня прошла последняя стадия моего лечения. Во вторник отпустили меня домой, а в четверг, т.е. сегодня сказали явиться. Врач достала из носа 2 зеленые силиконовые пластины, которые были пришиты друг к другу через носовую перегородку и были призваны фиксировать все ту же перегородку после операции от ее смещения. Размер пластин около 5 см длиной и около 1,5-2 см шириной в самом широком месте. Ощущение при их извлечении схожи с детампонироованием, но быстрее, не так больно и меньше крови. После, она почистила мне нос и приказала дышать. Дышалось очень легко, на много легче чем до операции. И до того, она сказала, что нормальное дыхание восстановится через 3  недели.
Запахи почти не чувствую, иногда слышно сильные и насыщенные запахи( например кофе), но очень отдаленно. Надеюсь, что такое легкое дыхание останется навсегда.  

пятница, 15 февраля 2013 г.

Операция

13.02.2013 наконец-то сделали мне операцию.  Эмоций просто море, т.к. подобное переживал впервые.
Перед тем как отвести в операционную укололи какое-то успокоительное, какое именно так я у медсестры узнать не смог. В действии данного препарата я несколько сомневался, т.к. сердце колотилось как бешеное, но через несколько минут все как рукой сняло. В операционную везли две пожилые сестры с очень  равнодушным видом, т.к. таких как я там человек по 10 в день режут. В передоперационной (термин придумал сам, а может он и существует) заставили раздеться  до трусов, одели на ноги какие-то сшитые из старых простыней бахилы и заставили карапкаться на операционный стол. Все я делал с железным спокойствием, несмотря на то что слева от меня сидел парень с закровавленным фартуком до пояса (с тонзилитом), а справа отходил от наркоза мужчина. Укрыли одеялом, привязали ремнем ноги к столу, очень туго зажали жгут на левой руке, вставили катетер в вену. Я посмотрел на анестезиолога, ждал хоть чьей то поддержки, но не дождался... Он кивнул головой кому-то. Я  почувствовал тяжесть в левой руке, которая подымалась к плечу....
Открываю глаза, стоит лучший друг, его девушка, моя любимая и папа. Но помню только друга который постоянно улыбался. Помню, может из-за того, что он был в ярко оранжевой спортивной кофте. В операционной я был около 3-х часов. Они хором мне не давали спать около 2-х часов(так сказала доктор) и поили с пробочки водой, т.к. очень сильно сушило и было горько во рту.
От наркоза отходил очень плохо, наверное из-за того, что относительно долго находился под ним и никогда не пил алкоголя. Вечером начало подташнивать и рвал кровью (доктор позже сказала что много нахлебался крови во время операции). На следующий день уже вставал с кровати. Ужасно болели мышцы брюшного пресса, шея, грудная клетка, ныли зубы и нос, катились постоянно слезы. Нос набитый бинтами и какими-то силиконовыми вставками. Размер у него такой, что можно смело идти работать в цирк клоуном без грима=)
 14.02, в обед доктор сказала, что надо подтянуть бинты. "Подтянуть" - это оказывается нужно вытащить около метра бинтов с одной ноздри и с другой. Ощущение не из приятных. Хотелось бы эту процедуру как-то описать, но не могу. В общем не сколько больно, сколько неприятно и противно.
Я думал, что очень буду хотеть есть, но ел через силу. Привкуса пищи нет. Чувствую вкус (соленое, сладкое и т.д.), температуру и консистенцию. Если интересно какого это, то попробуйте плотно закрыть нос двумя пальцами и затем попробовать пищу на вкус.
Оказывается лежать это очень мучительно, приходилось много ходить (на столько хватало сил), что бы хоть чуть-чуть стало легче. Усыпать приходилось только с обезбаливающим.
15.02 после обед вытаскивали остальные бинты из носа (где-то по метру с каждой ноздри). Эта процедура болезненней прошлой. В некоторых местах бинты по присыхали и их надо было с силой тащить (но их и так надо было сильно тащить, т.к. они очень туго набиты в носу). Все это делала девушка-интерн с очень спокойным видом, хотя крови было много, и знанием своего дела. Прекрасно чувствовал как в горло бежала теплая кровь и напился её изрядно, что потом и кушать не хотелось. Медсестра сделала укол чего-то кровоостанавливающего(около 15 кубов) и погнали меня  кровать. Но кровь шла еще минут 10-15.
Через пару часов боль в носу прошла, зубы перестали ныть. Уже иногда просачивается воздух через ноздри, но в основном они забиты слизью с кровью, так что получаются бульбашки. В общем чувствую себя легче.
ВСЕ эти дни, со мной находилась моя любимая, приезжали родители, сестренка и друзья. Всем им большое спасибо! Спасибо большое ребятам которые лежали(половина выписалась) со мной. Они мне пол ночи (после операции) протирали губы влажным тампоном и подавали воду. Все таки есть хорошие и не равнодушные люди на этом свете. Я сейчас тоже делаю, дня моего тески, которого сегодня про оперировали. 
Далее планирую писать о том как восстанавливается дыхание. Надеюсь мои заметки хоть немного помогут тем, кому необходимая подобная операция, но они сомневаются.

вторник, 12 февраля 2013 г.

***

В палате все спят, а я все по форумах лажу.
Начитался отзывов о септопластике (исправление носовой перегородки) и теперь уже 12-й час, а я все еще не сплю, хотя этой ночью поспал около 3-х часов, волнуюсь. Но тешат некоторые комментарии, в которых говорится о том, что нос задышал - этого хочется и мне.
Последний прием пищи, перед операцией, должен быть в 19:00, а воду можно пить до 2:00. Захожу я в столовую, а там 2 мужика кушают очень жадно, с большим аппетитом. Как оказалось впервые после операции. Один из них, поняв, что  новенький и уменя завтра операция, сказал:
-Ешь много... очень много, - потом, глянув на мой скромный судок с едой, добавил, - ешь все!
А что бы было понятней, почему он так говорил, операцию им сделали сутки назад и разрешено было есть  пить только... кефир=)

№9

Вот я уже в палате №9... 4 человека со мной и один я не резаный. На завтра назначена операция и мне как то страшновато. По отделению медсестры возят пациентов с хирургии. Они мне похожи на амеб - медленно моргают, взгляд в никуда, одним словом - отходят от наркоза. А мне страшна не сколько операция, а действие наркоза и как от него отходить. Никогда с таким не сталкивался. Такое чувство, что только в фильмах человек вот так просто усыпает....